Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo1Q924W9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms