Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b5Q923D4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms