Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf3Q922U1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms