Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Clip1Q922J3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Clip1Q922J3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Clip1Q922J3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms