Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp4Q921I6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Sh3bp4Q921I6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Sh3bp4Q921I6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Sh3bp4Q921I6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Sh3bp4Q921I6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Sh3bp4Q921I6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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