Protein–RNA interactions for Protein: Q91YT2

Rnf185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf185Q91YT2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf185Q91YT2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf185Q91YT2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms