Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx4Q91YJ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms