Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y10

Pcdhac1, Protocadherin alpha C1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhac1Q91Y10 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhac1Q91Y10 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdhac1Q91Y10 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcdhac1Q91Y10 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcdhac1Q91Y10 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcdhac1Q91Y10 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcdhac1Q91Y10 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcdhac1Q91Y10 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcdhac1Q91Y10 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms