Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l3Q91XE9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3l3Q91XE9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms