Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna2Q91X60 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna2Q91X60 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms