Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub2Q91WG3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms