Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usb1Q91W78 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms