Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd3Q91W18 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms