Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms