Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NifkQ91VE6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms