Protein–RNA interactions for Protein: Q91V17

Znrf1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf1Q91V17 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znrf1Q91V17 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znrf1Q91V17 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms