Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms