Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms