Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt25Q8VCW2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms