Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VCE4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VCE4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VCE4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8VCE4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 499.2 ms