Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BbxQ8VBW5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms