Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmx1Q8VBT0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmx1Q8VBT0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmx1Q8VBT0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms