Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup35Q8R4R6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms