Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11fip5Q8R361 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip5Q8R361 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip5Q8R361 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms