Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c5Q8R2T8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms