Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms