Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r200Q8R281 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r200Q8R281 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r200Q8R281 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r200Q8R281 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r200Q8R281 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r200Q8R281 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r200Q8R281 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r200Q8R281 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r200Q8R281 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r200Q8R281 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r200Q8R281 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r200Q8R281 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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