Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rnf183Q8QZS5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf183Q8QZS5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms