Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncapd2Q8K2Z4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd2Q8K2Z4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms