Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccm2Q8K2Y9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms