Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phf13Q8K2W6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms