Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Paf1Q8K2T8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms