Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms