Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo18Q8K2I9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo18Q8K2I9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo18Q8K2I9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo18Q8K2I9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo18Q8K2I9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo18Q8K2I9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo18Q8K2I9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo18Q8K2I9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo18Q8K2I9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo18Q8K2I9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo18Q8K2I9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo18Q8K2I9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo18Q8K2I9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms