Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mtmr3Q8K296 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr3Q8K296 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr3Q8K296 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr3Q8K296 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr3Q8K296 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr3Q8K296 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr3Q8K296 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtmr3Q8K296 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtmr3Q8K296 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtmr3Q8K296 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtmr3Q8K296 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtmr3Q8K296 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms