Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms