Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Glis1Q8K1M4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis1Q8K1M4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms