Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c1Q8K193 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c1Q8K193 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms