Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkn3Q8K045 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkn3Q8K045 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkn3Q8K045 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkn3Q8K045 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkn3Q8K045 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms