Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm17Q8JZX4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms