Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a8Q8JZR6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc4a8Q8JZR6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms