Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afg3l2Q8JZQ2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afg3l2Q8JZQ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afg3l2Q8JZQ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Afg3l2Q8JZQ2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Afg3l2Q8JZQ2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l2Q8JZQ2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms