Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgef1bQ8JZL7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgef1bQ8JZL7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgef1bQ8JZL7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgef1bQ8JZL7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rasgef1bQ8JZL7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rasgef1bQ8JZL7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.9 ms