Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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