Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hpf1Q8CFE2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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