Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms