Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN6

Txnl1, Thioredoxin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnl1Q8CDN6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txnl1Q8CDN6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnl1Q8CDN6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms