Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riox2Q8CD15 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riox2Q8CD15 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms