Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacnb2Q8CC27 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacnb2Q8CC27 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms