Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms